Foldit

Foldit是一个实验性的蛋白质折叠电子游戏，结合了众包与分布式计算的思想。由华盛顿大学的计算机科学和工程学系和生物化学学系（同一批人中，很多人也参与创建Rosetta@home）联合共同开发。

Foldit提供一系列教程，让用户试着操纵简单的类蛋白质构造，并定期更新以真实蛋白质结构为基础的谜题。该程序让用户在工具辅助解谜，就能够得出实际的蛋白质模型。每当结构被变动，一个“分数”会根据折叠的完善程度给出。Foldit用户可以创立加入小组，分享各自的方案。也有小组高分榜。

生物制造主要蛋白质结构的方式（蛋白质生物合成）在原理上已经为人类所理解，此即蛋白质DNA测序的方法。而解明肽链是如何折叠成三维的蛋白质结构更为困难；虽然大致的程序已经为人所知，但蛋白质结构预测还是需要大量的运算。

Foldit尝试利用人脑天生的三维图形匹配能力。目前该程序出的谜题都是基于已被人们清楚了解的蛋白质；透过分析人类在解这些谜题时的直觉思考途径，研究者希望能改进现有蛋白质折叠软件所用的算法。

2010年科学杂志《自然》杂志上的一篇论文称，Foldit的57,000名参与者提供了有用的结果，这些结果与算法计算的解决方案相匹配或表现优异^[1]^[2]。

成就[编辑 | 编辑源代码]

2011年，Foldit玩家帮助解读了Mason-Pfizer猴病毒（M-PMV）逆转录病毒蛋白酶的晶体结构。科学家们一直研究艾滋病的逆转录酶的晶体结构，这是一个已有十五年之久未解决的科学问题，这种蛋白质酶是艾滋病毒在活体细胞中复制和繁殖自己的重要关键，但在游戏中逆转录酶的结构在十天内被玩家们破解^[3]^[4]。

↑ ^1.0 ^1.1 John Markoff. In a Video Game, Tackling the Complexities of Protein Folding. The New York Times. 10 August 2010 [12 February 2013].
↑ https://www.nature.com/articles/nature09304
↑ Khatib, F.; Dimaio, F.; Cooper, S.; Kazmierczyk, M.; Gilski, M.; Krzywda, S.; Zabranska, H.; Pichova, I.; Thompson, J. Crystal structure of a monomeric retroviral protease solved by protein folding game players. Nature Structural & Molecular Biology. 2011, 18 (10): 1175. doi:10.1038/nsmb.2119.
↑ Praetorius, Dean. Gamers Decode AIDS Protein That Stumped Researchers For 15 Years In Just 3 Weeks. The Huffington Post. 2011-09-19 [17 November 2016].